Al igual que con los STR, la base es la misma. Sin embargo, se analizan más marcadores genéticos porque el contenido de información por marcadores es menor para los SNP.

La variación genética que está presente en un animal, se origina en ambos padres. La mitad de la variación se origina en el padre, mientras que la otra mitad proviene de la madre.

Para la verificación de parentesco, habitualmente se visualizan 200 hasta 400 características genéticas. En este proceso, se está midiendo la composición genética real (A, C, G o T). La composición/variabilidad en una descendencia debe corresponder a la composición/variabilidad de los posibles padres con los que se realiza la comparación. En estos dos ejemplos, se muestra cómo se aplican las reglas básicas en la verificación de parentesco.

Marcador

Descendencia

Madre

Padre

SNP01

AT

AA

TT

SNP02

GC

GC

CC

SNP03

TT

CT

TT

SNP04

AC

AC

AC

SNP05

CC

CC

CT

SNP06

CT

CC

CT

En la tabla anterior se proporciona un ejemplo de un parentesco correcto. En esta tabla, se muestra el ADN de tres individuos: de la descendencia (columna izquierda), de una madre potencial (columna central) y de un padre potencial (columnas derecha). En cada línea se muestra una variante. En este caso, todas las variantes en la descendencia están presentes en los padres: la paternidad es correcta.

Marcador

Descendencia

Madre

Padre

SNP01

AA

AA

TT

SNP02

GC

GC

CC

SNP03

CC

CT

TT

SNP04

AC

AC

AC

SNP05

CC

CC

CT

SNP06

CT

CC

CT

En la segunda tabla se proporciona un ejemplo de parentesco incorrecto. En esta tabla, se muestra el ADN de tres individuos: de la descendencia (columna izquierda), de una madre potencial (columna central) y de un padre potencial (columnas derecha). En cada línea se muestra una variante. En este caso, hay varias variantes en la descendencia que no están presentes en los padres: la paternidad no es correcta.

Cuando se comprueban de 200 a 400 fragmentos genéticos diferentes, la probabilidad de que no se detecte un parentesco incorrecto es muy pequeña. Los fragmentos genéticos que se utilizan para la verificación e identificación de parentesco no proporcionan información sobre propiedades como el color y la calidad de un animal, planta o humano, ya que los fragmentos no están codificados.

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